Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE3CQ15386 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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UBE3CQ15386 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE3CQ15386 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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