Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCM1Q15154 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms