Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NCAPHQ15003 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NCAPHQ15003 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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