Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms