Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAPQ14761 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms