Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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