Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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