Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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COL9A3Q14050 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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COL9A3Q14050 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL9A3Q14050 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL9A3Q14050 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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