Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBA3CQ13748 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TUBA3CQ13748 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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