Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HTR4Q13639 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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