Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CUL4AQ13619 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms