Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL1Q13616 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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