Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms