Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ATRQ13535 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ATRQ13535 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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