Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBB3Q13509 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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