Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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