Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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