Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLN3Q13286 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLN3Q13286 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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