Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SRSF5Q13243 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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