Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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LMAN2Q12907 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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LMAN2Q12907 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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LMAN2Q12907 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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LMAN2Q12907 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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LMAN2Q12907 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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