Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TROQ12816 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TROQ12816 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TROQ12816 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TROQ12816 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TROQ12816 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TROQ12816 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TROQ12816 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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