Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMA1Q12791 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms