Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF5Q12774 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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