Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP1B1Q10567 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP1B1Q10567 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms