Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNA1Q09470 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms