Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDE4DQ08499 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms