Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ERCC6Q03468 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERCC6Q03468 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms