Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AP000894.2-203ENST00000580612 439 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZIK1P1-201ENST00000456074 1459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC025682.1-204ENST00000580045 733 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 FBXO9-203ENST00000370939 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNB1Q02641 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms