Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms