Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HPCAP84074 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HPCAP84074 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HPCAP84074 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms