Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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