Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COG7P83436 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COG7P83436 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms