Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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IRX1P78414 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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IRX1P78414 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRX1P78414 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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