Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVFRD-1P60508 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms