Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DCDC1P59894 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DCDC1P59894 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms