Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF10P55107 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF10P55107 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms