Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAD23AP54725 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAD23AP54725 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms