Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA2D1P54289 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms