Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRCA2P51587 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRCA2P51587 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms