Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTPAP49638 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTPAP49638 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TTPAP49638 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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