Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMPHP49418 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMPHP49418 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMPHP49418 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMPHP49418 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMPHP49418 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms