Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FNTBP49356 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms