Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK8P49336 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK8P49336 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms