Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACADSBP45954 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms