Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGER3P43115 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms