Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms