Protein–RNA interactions for Protein: P29475

NOS1, Nitric oxide synthase, brain, humanhuman

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOS1P29475 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOS1P29475 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOS1P29475 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms