Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms