Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SSFA2P28290 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms