Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPN3P26045 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms